Micron: lo que no sabemos sobre la nueva variante del SARS-CoV-2


Aún no sabemos si la nueva variante del SARS-CoV-2 llamada omicron es más transmisible, si reemplazará a otras variantes, si es más virulenta, no sabemos cómo afectará a los niños o si escapará. vacunas actuales. Sabemos que para controlarlo y la vacunación debe ser global

Ignacio López-Goñic

IGNACIO LÓPEZ-GOÑI Catedrático de Microbiología, Universidad de Navarra

No sabemos si es más transmisible, no sabemos si reemplazará a otras variantes, no sabemos si es más virulento y causa una enfermedad más grave, no sabemos si será más fácil de reestablecer. infectar, no sabemos si será más peligroso en los niños pequeños, no sabemos si escapará a las vacunas actuales, no sabemos si se extenderá por todo el planeta, pero sabemos que tenemos que mantener un ojo en él.

La nueva variante de SARS-CoV-2, B.1.1.529, denominada omicron, fue detectada por PCR entre el 11 y el 23 de noviembre en Sudáfrica, en la provincia de Gauteng (77 casos), Botswana (4 casos), en Hong Kong – Kong (un caso), Israel (un caso) y Bélgica (un caso). Parece que se ha extendido muy rápidamente en la región de Gauteng, pero hay que tener en cuenta que es una zona con muy pocos casos de Covid-19 y con una tasa de vacunación muy baja. Eso pudo haber influido. ¿Es realmente más transmisible o es un efecto de la población en la que está aislado? Se desconoce cómo se comportará esta variante en otra población en la que la incidencia y las coberturas de vacunación son mayores. Pero debemos estar atentos.

B.1.1.529 tiene más de 50 mutaciones en su genoma en comparación con la secuencia original de Wuhan. Treinta y dos de ellos en la región de la proteína S.

Lo que preocupa a los científicos es la acumulación de mutaciones en esa región, porque algunas de estas mutaciones ya habían sido detectadas en otras variantes, pero no todas juntas en la misma variante. Por lo tanto, esta variante ya está clasificada como variante preocupante. Lo que debe analizarse más que el número de mutaciones es el efecto que pueden tener todas juntas. La mutación en el genoma es una cosa y el efecto que puede tener sobre la biología del virus es otra muy distinta. El efecto no tiene por qué ser acumulativo, puede haber fenómenos compensatorios: el efecto de una mutación puede compensarse con el de otra.

Pero esta variante acumula mutaciones ligadas a un posible escape del sistema inmunológico y un posible aumento de la transmisibilidad.

Aparecen nueve mutaciones (en rojo) en otras variantes alfa, beta, delta, gamma. Once (en azul) son nuevas. Quince mutaciones se encuentran en el sitio de unión al receptor (RBD) y algunas (N440K, S477N, Q498R) afectan la unión al receptor ACE2 y pueden afectar su capacidad para infectar células. Otros pueden afectar la transmisibilidad (H655Y, N679K, P681H), y hay algunos que pueden provocar cambios en la proteína y afectar su reactividad con los anticuerpos:

Efectos antigénicos de las mutaciones de la nueva variante. BloomLab

Por otro lado, un análisis filogenético de los genomas de esta variante sugiere que probablemente lleva meses en circulación, pero hasta ahora no se ha detectado:

Análisis filogenético de la nueva variante. Trevor Bedford

¿Hay motivos para la histeria y la alarma generalizadas? No actualmente. Es más lo que no sabemos que lo que sabemos. Pero debes permanecer alerta.

¿Cancelamos todos los vuelos a Sudáfrica? No tiene mucho sentido por varias razones. Sudáfrica es probablemente el único país africano que hace los «deberes» y monitorea el genoma del virus. Por eso lo detecta. Si no buscamos activamente nuevas variantes, no las detectaremos, pero eso no significa que no aparecerán. Castigar al que lo hace bien es un error. No podemos descartar, es muy probable, que surjan nuevas variantes en otras áreas donde no son buscadas. Entonces, ¿estamos cancelando todos los vuelos a África? Esta variante ya se ha descubierto en Hong Kong y Bélgica, y probablemente, como se sugiere, en otros lugares del planeta durante mucho tiempo.

Necesitamos tiempo para aprender más sobre esta variante. Pero lo que esto demuestra una vez más es que estamos en una pandemia global y lo que está sucediendo en otros países nos afecta. Cuanto más infectados hay en el mundo, más virus hay, más variantes pueden surgir. La vacunación debería ser global. Y en África, algo más del 7% de la población está vacunada. Eso es lo que debería alarmarnos.

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La conversación, se publicó en el blog del autor, microBIO.

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